单细胞RNA测序

2019-08-14

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新生命霍普建立的基于Drop-seq技术的单细胞RNA测序平台,采用微流控的液流技术,首先制备含有单个细胞和单个珠子的液滴,接着进行细胞裂解和反转录,然后制备单细胞RNA测序文库,再利用二代测序技术进行检测,最后取得数据后,利用专门的生物信息学算法分析最初细胞来源的样本的细胞类群。

单细胞RNA测序能够独立地提供每个细胞的RNA表达谱,并鉴定异质细胞群中的稀有细胞。比如,尽管肿瘤异质性可归因于累积突变,但即使是遗传上相同的细胞在相同环境下也可能表现出基因和蛋白表达水平的差异,从而导致耐药性的产生,单细胞RNA测序就能够发现这些稀有个体。目前本平台已成功应用在肿瘤组织的研究上,对于肿瘤细胞亚群和特异分子标签产生了前所未有的发现。

利用单细胞测序技术对常见的肿瘤类型进行精确解码,将有利于实现在分子水平上对癌症发生和发展的认识,帮助人们建立肿瘤诊断、治疗及预防的新策略。因此,建立完整的肿瘤细胞图谱,对于人类了解肿瘤乃至最终攻克癌症这一顽疾具有十分重要的意义。


平台优势:

(1)技术团队完全走通从平台构建、样本单细胞悬浮处理、微流控系统控制、单细胞转录组测序文库准备、原始二代测序数据处理、单细胞生物信息学分析、大数据整合及人工智能深度挖掘的整个流程(多数其它团队只能能够覆盖其中一二);

(2)自组装平台,全过程自主可控,根据实际进展调整实验计划,优化成本控制;

(3)应用大数据与深度神经学习网络实现对单细胞基因表达谱的快速识别,引入人工智能方法重新识别肿瘤样本中的细胞;

(4)技术团队可紧密对接研究课题组,具有持续创新、研发和整合的能力。

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